曾是石河子蘑菇湖水庫最大污染源的石河子天宏紙業股份有限公司，上環保設施后，污水達標排放。經“十一五”初期到今年對蘑菇湖水庫水體監測，結果顯示：COD（化學需氧量）均值已經從75毫克/升下降到45毫克/升，蘑菇湖排出水質明顯好轉。
6月20日，記者隨天山環保世紀行執法檢查組在蘑菇湖水庫看到，水庫邊飛著叫不上名字的水鳥，湖面上飄著兩只小木船和漁網。曾多次來此地的檢查組成員說，現在的蘑菇湖比以前好多了。
陪同檢查組的石河子市人大常委會副主任郭斯孚在岸邊告訴記者，以前水庫四周泛著1米多高的白沫，水呈醬油色，臭氣熏人，每次來，都要捂住鼻子跑到上風口，否則就沒辦法呼吸。現在與3年前相比，臭味少了，湖水相對清了，湖區經常還可以看到一些小魚蝦，湖區生態已有明顯好轉。
蘑菇湖水庫是石河子墾區容量最大的水庫，庫容達1.8億立方米，承擔著灌溉下游近百萬畝土地的重任。多年來，石河子工業廢水以及生活污水不斷向下游蘑菇湖水庫排放，致使水庫COD等污染物嚴重超標，水質長期呈現重度污染。不僅使使用該水源澆灌的農作物受到污染減產，而且給周邊居民的飲用水造成了威脅。
為了完成削減石河子市COD總量控制指標，提高水庫水質質量，確保下游農業灌溉安全，2007年8月，石河子黨委、政府果斷關停了天宏紙業的制漿黑液工段，要求企業限期治理，并下了死命令“環保一天不達標一天不開機，一年不達標一年不開機”。
2007年10月，天宏公司投資7500萬元建設的黑液資源化項目停產進行環保項目建設，2008年8月進行設備調試運行，同年12月一次通過環保部門驗收，達標排放。2008年公司共實現COD減排任務13000多噸，2009年COD減排8727噸，BOD減排1868.4噸；全年處理廢水480萬立方米，運行費用近600多萬元，為自治區、兵團減排起到了一定的作用。
對此，檢查組專家認為：多年來，石河子對蘑菇湖的污染治理做了一些工作，水質較以前也有了一定改觀，但始終還沒有從根本上解決問題，還要下決心制定切實可行的治理計劃，加強監督監管，徹底治理好蘑菇湖的污染問題。
